タンパク質フォールド認識のための3D-1Dスレッディング法

タンパク質フォールド認識へのスレッディングアプローチは、クエリー配列が既に解決されたフォールドにどれだけ適合するかを評価しようとします。3D-1Dスレッダーは、クエリー配列から予測された3次元情報の1次元文字列を、ターゲット構造の対応する特徴と照合することに依存します。多くの場合、これは配列比較と組み合わされます。配列情報と構造情報の組み合わせは、配列または構造の独占的使用に対して、フォールド認識の精度を向上させることが示されています。本論文では、スレッディング法が導入されてからの進展をレビューし、最近の進展を強調します。我们は、従来とは異なる3D-1Dスレッダーである2つの新興方法、すなわち近接相関マトリックスと並列カスケード同定に焦点を当てます。