Méthodes de threading 3D-1D pour la reconnaissance de la conformation des protéines

L'approche de threading pour la reconnaissance de la conformation des protéines tente d'évaluer dans quelle mesure une séquence requête s'adapte à une conformation déjà résolue. Les threaders 3D-1D s'appuient sur l'appareillage de chaînes 1-dimensionnelles d'informations 3-dimensionnelles prédites à partir de la séquence requête avec les caractéristiques correspondantes de la structure cible. Dans de nombreux cas, cela est combiné avec une comparaison de séquences. La combinaison d'informations de séquence et de structure a démontré qu'elle améliore l'exactitude de la reconnaissance de la conformation, par rapport à l'utilisation exclusive de la séquence ou de la structure. Dans cet article, nous passons en revue les avancées réalisées depuis l'introduction des méthodes de threading il y a une décennie, en mettant en lumière les avancées récentes. Nous nous concentrons sur deux méthodes émergentes qui sont des threaders 3D-1D non conventionnels : les matrices de corrélation de proximité et l'identification en cascade parallèle.