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초록 정확하고 신속한 분류학적 분류는 다양한 환경에서 유기체와 대사물을 체계적으로 탐색하는 데 필수적입니다. 생물학적 분류 트리를 위한 많은 도구가 개발되었지만, 제한이 있으며 화학적 분류 트리를 구축하는 간소화된 방법이 부족합니다. 우리는 생물학적 및 화학적 분류 분석을 위한 종합적이고 자동화된 인터랙티브 플랫폼인 iPhylo Suite(https://www.iphylo.net/)를 소개합니다. iPhylo Suite에는 생물학적 및 화학적 분류 트리를 인터랙티브하게 구축하고 주석 달기 위한 Tree 및 Visual 웹 기반 모듈과 로컬 사용 및 고성능 컴퓨팅 클러스터에 배포하기 위한 독립 명령줄 인터페이스(CLI) 모듈이 포함되어 있습니다. 더욱이, iPhylo 시각화 모듈은 R로 완벽하게 구현되어 있어 사용자가 로컬로 진행 상황을 저장하고 기본 R 코드를 수정할 수 있게 해줍니다. 마지막으로, iPhylo CLI 모듈은 분석을 모든 계층적 관계형 데이터베이스로 확장합니다. 요약하자면, iPhylo Suite는 생물학적 및 화학적 특성에 대한 심층 분류 분석을 위한 통합 인터랙티브 프레임워크를 제공합니다. 하이라이트 생물학적 및 화학적 분류 분석 및 시각화를 위한 플랫폼. 로컬 또는 HPC 배포를 위한 독립 명령줄 인터페이스 모듈. 세션 저장 옵션이 있는 R 기반 인터랙티브 시각화 모듈. 분류학을 넘은 분석을 위한 맞춤형 계층적 데이터베이스 지원.
Li et al. (목,)은 이 질문을 연구했습니다.