상관관계를 가지는 단일 염기 다형성과 관련된 유전자 연관 연구를 위한 다중 테스트 보정 방법

다중 테스트는 많은 수의 단일 염기 다형성(SNP) 마커를 사용하는 유전자 연관 연구에서 도전적인 문제입니다. 이러한 마커 중 다수는 연결 불균형(LD)을 나타냅니다. 다중 테스트를 적절하게 조정하지 않으면 과도한 거짓 양성을 생성하거나 진정한 양성 신호를 간과할 수 있습니다. 다중 비교에 대한 보정을 위한 보닛페로니 방법은 계산이 쉬우나, LD가 있을 경우 보수적이라는 것이 잘 알려져 있습니다. 반면, 순열 기반 보정은 SNP 간의 LD를 정확하게 계산할 수 있지만, 계산 비용이 많이 듭니다. 이 연구에서는 SNP 마커를 사용하는 연관 연구를 위한 새로운 다중 테스트 보정 방법을 제안합니다. 우리는 이 방법이 최근 개발된 방법들보다 간단하고 빠르며 더 정확하다는 것을 보여주며, 시뮬레이션 데이터와 실제 데이터를 사용한 순열 기반 보정과도 비교할 수 있음을 입증합니다. 또한, 이 방법이 전체 유전체 연관 연구에서 유형 I 오류를 제어하는 데 어떻게 사용될 수 있는지를 설명합니다. 제안된 방법의 효율성과 정확성은 SNP 데이터 세트에서 높은 마커 간 LD가 있을 때 다중 테스트 조정에 매력적인 선택이 되도록 합니다.