항체 구조의 보편적인 조합 설계로 다양한 CDR 서열을 이식하는 방법: 생물정보학적 접근

항체(Ab) 인간화는 하이브리도마 유래 단클론 항체(mAbs)로부터 임상적으로 관련된 생물학적제를 생성하는 데 중요합니다. 본 연구에서는 단백질 데이터 뱅크의 항체 구조 정보를 알려진 마우스 돌연변이 데이터와 통합하여 항체의 상호작용 결정 영역(Complementarity Determining Region, CDR)의 기능적 구조 보존을 위한 중요한 프레임워크 위치(무거운 10개, 가벼운 7개)의 보편적인 컨센서스를 구축했습니다. FR 컨센서스를 기반으로, 여기에서는 CDR 이식을 통해 외부 항체를 인간화하기 위해 적합한 보편적인 조합 라이브러리를 설명합니다. 생쥐 항인간 EGFR Fab M225의 6개의 CDR을 M225와 구조적 유사성이 낮은 인간 FR 서열에 이식했으며, 17개 FR 컨센서스 위치에서 자연적으로 관찰된 아미노산 다양성의 순열을 포함합니다. 조합 라이브러리에서 phage 표시 인간화된 M225 Fab을 발현하는 10개의 클론을 선택했습니다. 놀랍게도, 10개 클론 중 2개는 M225보다 더 강한 친화력으로 EGFR에 결합하는 것으로 나타났습니다. 세포 기반 분석에서는 선택된 10개의 클론이 EGFR 인산화를 차단하여 세포 증식을 방해하는 에피토프 특이성을 유지하는 것으로 나타났습니다. 우리의 결과는 CDR의 결합 형태를 협력적으로 지원하는 보편적이고 구조적으로 강인한 거의 CDR 세트의 FR 위치가 존재함을 시사합니다.