異なるCDR配列をグラフトするための抗体フレームワークの普遍的な組み合わせ設計：バイオインフォマティクスアプローチ

抗体（Ab）ヒューマナイゼーションは、ハイブリドーマ由来のモノクローナル抗体（mAbs）から臨床的に関連するバイオロジクスを生成するために重要です。本研究では、抗体の機能的立体配置の保存に重要なフレームワーク位置（10の重鎖および7の軽鎖）の普遍的コンセンサスを構築するために、Protein Data Bankからの抗体構造情報と既知のバック・トゥ・マウス突然変異データを統合しました。FRコンセンサスに基づいて、CDRグラフティングによって外因性抗体をヒューマナイズするための普遍的な組み合わせライブラリをここに記述します。マウス抗ヒトEGFR Fab M225の6つのCDRが、自然に観察されたアミノ酸多様性の順列を17のFRコンセンサス位置に組み込んだ異なる（M225との低いFR配列類似性）ヒトFR配列にグラフトされました。ファージ表示ヒューマナイズドM225 Fabを発現する組み合わせライブラリから10個のクローンが選択されました。驚くべきことに、10個のうち2つのクローンは、M225よりも強い親和性でEGFRに結合することが確認されました。細胞ベースのアッセイは、選択された10個のクローンがEGFRリン酸化を阻害し、したがって細胞の増殖を妨げることによってエピトープ特異性を保持していることを示しました。我々の結果は、CDRの結合立体配置を協調的に支える普遍的で構造的に剛直な近CDRセットのFR位置があることを示唆しています。