참조 게놈 없이 차세대 서열 분석 데이터의 품질과 복잡성을 결정하기

우리는 k-mer 빈도를 분석하여 서열 데이터 세트의 품질과 비교 가능성을 정렬 없이 평가하는 오픈 소스 kPAL 패키지를 설명합니다. 우리는 kPAL이 높은 중복률, 라이브러리 키메라, 오염 및 라이브러리 준비 프로토콜의 차이와 같은 기술적 인공물을 감지할 수 있음을 보여줍니다. kPAL은 또한 미생물 군집의 복잡성과 다양성을 성공적으로 포착하고 미생물 군집의 변화를 연구하는 강력한 수단을 제공합니다. 이들 기능을 종합하면, kPAL은 참조 서열이 없는 경우에도 시퀀스 라이브러리의 품질과 비교 가능성을 결정하는 매력적이고 폭넓게 적용 가능한 도구입니다. kPAL은 https://github.com/LUMC/kPAL 에서 무료로 사용할 수 있습니다.