تعد نقائل العقد اللمفاوية الرقبية أقوى عامل تنبؤي في سرطان اللسان الفموي، ومع ذلك تعتمد الإرشادات السريرية الحالية بشكل رئيسي على عمق الغزو لتوجيه عملية إزالة العنق الانتقائية. تؤدي هذه الطريقة إلى جراحة غير ضرورية لحوالي 70% من المرضى. مستضدات السرطان الخصوي (CTAs) هي عائلة من الجينات المرتبطة بشراسة الورم وقد تكون بمثابة علامات حيوية تنبؤية لانتشار العقد. تم استخدام تحليل متعدد الخطوات يدمج بيانات عامة واسعة النطاق، بما في ذلك الميكروأري (GSE78060)، وتسلسل RNA الحجمي الصادر عن أطلس جينوم السرطان (TCGA)، وتسلسل RNA أحادي الخلية (GSE103322)، لتحديد جينات CTAs النشطة في سرطان اللسان الفموي. تم التحقق من الجينات المختارة باستخدام تحليل RNA الخاص بمنصة NanoString nCounter لـ 16 مريضًا خضعوا لاستئصال اللسان الجراحي مع إزالة العنق الانتقائية. تم تطبيق خوارزميات تعلم الآلة، بما في ذلك أشجار القرار، وضغط الجوار العشوائي الموزون (t-SNE)، وشبكات العصبية الالتفافية (CNN)، لتقييم القوة التنبؤية لانتشار العقد. حدد التحليل الحسابي في البداية 40 جينًا نشطًا في السرطان، وكان من بينها أربعة جينات (LY6K و MAGEA3 و CEP55 و ATAD2) الأكثر دلالة على انتشار العقد. في مجموعة المرضى لدينا، أكدت بروفايل NanoString nCounter مجتمعة مع تعلم الآلة أن هذه الجينات الأربعة ذات دلالة تنبؤية عالية. نقدم أداة تشخيص وراثي تعتمد على CTAs قادرة على التفريق بين المشاركة العقدية في سرطان اللسان الفموي. قد تقلل هذه الطريقة من عمليات إزالة العنق غير الضرورية، مما يقلل من الوفيات الجراحية.
درس سميث وآخرون (م.) هذا السؤال.