Um atlas de referência integrado de célula única do endométrio humano

A composição celular complexa e dinâmica do endométrio humano permanece pouco compreendida. Atlases anteriores de célula única do endométrio perfilavam poucos doadores e careciam de consenso na definição dos tipos celulares. Apresentamos o Atlas de Células Endometriais Humanas (HECA), um atlas de referência de célula única de alta resolução (313.527 células) combinando conjuntos de dados de transcriptômica de célula única endometrial publicados e novos de 63 mulheres com e sem endometriose. O HECA atribui consenso e identifica tipos celulares previamente não relatados, mapeados in situ usando transcriptômica espacial e validados com um novo conjunto de dados de núcleos únicos independente (312.246 núcleos, 63 doadores). No functionalis, identificamos coordenação intrincada entre células estromais e epiteliais via sinalização de fator de crescimento transformador beta (TGFβ). No basalis, definimos a sinalização entre fibroblastos e uma população epitelial que expressa marcadores de progenitor. A integração do HECA com dados de estudos de associação genômica em larga escala de endometriose destaca células estromais decidualizadas e macrófagos como os mais prováveis de estarem desregulados na endometriose. O HECA é um recurso valioso para o estudo da fisiologia e distúrbios endometriais, e para orientar o desenvolvimento de sistemas microfisiológicos in vitro.