ALK融合陽性およびALK融合陰性の非小細胞肺癌患者のゲノムプロファイルの比較

要旨 背景：間質性リンパ腫キナーゼ（ALK）融合イベントは、非小細胞肺癌（NSCLC）患者の遺伝的変異の3〜7%を占めています。本研究は、大規模なNSCLC患者群におけるALK融合陽性およびALK融合陰性の状況を探ることを目的としました。 方法：2020年から2023年までYinfeng Gene Technology Co., Ltd.臨床検査所で次世代シーケンシングを受けたNSCLC患者のホルマリン固定パラフィン包埋標本が本研究に含まれました。 結果：本研究では、5,622のNSCLCサンプル中で180人（3.20%）の患者がALK融合陽性と判定されました。ALK陽性コホート内で、228のALK融合が特定されました。さらに、DAB1-ALK、KCMF1-ALK、KIF13A-ALK、LOC643770-ALK、およびXDH-ALKを含む5つの新規ALK融合パートナーが特定されました。ALK融合陽性の場合、TP53変異が最も一般的（26.3%）で、次いでCDKN2A（8.4%）、上皮成長因子受容体（EGFR、5.6%）、ALK（5.6%）が続きました。対照的に、ALK融合陰性のNSCLC患者ではEGFR変異が最も一般的（51%）で、次いでTP53（42.7%）、KRAS（11.6%）、CDKN2A（11.3%）が続きました。また、ALK融合とEGFR変異が共存する10例も特定されました。特に、ALK融合陽性率は若年患者（p < 0.0001）および女性患者（p = 0.0429）で高かったです。さらに、陽性ALK検査結果は、特に50%のカットオフを適用した場合に、高いプログラム死リガンド1発現を持つ患者においてより多く見られました。 結論：これらの知見は、ALK融合を持つNSCLC患者の個別化医療に役立つ貴重なゲノムの洞察を提供します。