병변 중증도에 따른 숙주 내 유전적 다양성 변화 분석: HPV16 장기 샘플

초록 인유두종 바이러스 16형(HPV16)은 자궁경부암의 가장 일반적인 원인이지만, 대부분의 감염은 일시적이며 병변이 암으로 진행되지 않습니다. 초기 암 위험 분류를 위한 특정 바이오마커가 부족합니다. 본 연구는 다양한 자궁경부 병변 중증도(정상, 저급, 고급)를 가진 HPV16 감염 여성의 장기 샘플에서 숙주 내 HPV16 유전체 변이를 탐구하는 것을 목표로 했습니다. TaME-seq 심층 염기서열 분석 프로토콜을 사용하여 40명의 개인으로부터 수집된 102개의 샘플에 대한 전체 유전체 HPV16 서열을 생성했습니다. 바이러스 유전체에서 단일 염기 변이(SNV)와 숙주 내 SNV(iSNV)가 확인되었습니다. 대다수의 개인은 고유한 SNV 세트를 가지고 있었으며, 이러한 SNV는 시간에 따라 안정적이었습니다. 전반적으로, 고급 샘플에서의 iSNV와 APOBEC3-유도 iSNV의 수가 정상 및 저급 샘플에 비해 유의하게 낮았습니다. 정상 샘플에서 고급 샘플에 비해 시간 경과에 따라 APOBEC3-유도 iSNV의 수가 유의하게 증가한 것으로 관찰되었습니다. 우리의 결과는 고급 병변에서 iSNV 및 APOBEC3-유도 iSNV의 발생이 낮다는 점이 새로운 바이오마커 발견에 영향을 미칠 수 있으며, HPV 유발 자궁경부 전암 병변의 조기 분류에 도움이 될 수 있음을 나타냅니다.