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Rubus는 장미과에서 가장 큰 속으로, 세계 여러 서식지에 분포하는 1400종 이상의 종을 포함하고 있으며, 북반구의 온대 지역에서 높은 종 다양성을 보입니다. 여러 Rubus 종은 귀중한 과일을 위해 재배됩니다. 그러나 속 내 분류와 계통적 관계는 아직 잘 이해되지 않았습니다. 본 연구에서 우리는 Rubus의 17개 플라스토믹 염기서열을 시퀀싱하고 조립 및 특성 분석을 실시했으며, 이 속의 이전에 발행된 47개의 플라스토믹과 비교 유전체학을 통합하였습니다. Rubus의 64개 플라스토믹은 크기가 155,144에서 156,700 bp 사이인 전형적인 사중 구조를 나타내었고, 87개의 단백질 암호화 유전자, 37개의 tRNA 유전자 및 8개의 rRNA 유자를 포함한 132개의 유전을 보유하고 있습니다. 모든 플라스토믹은 유전자 배열, 다양한 유형의 긴 반복 및 단순 서열 반복(SSRs)의 빈도, 코돈 사용 및 단백질 암호화 유전자의 선택 압력에서 보수적입니다. 하지만 Rubus 플라스토믹에서는 IR의 약간의 수축 및 확장, SSR 및 긴 반복의 수 변화, 특정 클레이드의 일부 유전자가 강한 또는 약한 정수 선택을 겪는 등 몇 가지 차이점도 있습니다. 전체 플라스토믹에 기반한 계통발생 분석 결과 Rubus의 단계가 강력하게 지지되었고, 6개의 아속과 일치하는 6개의 클레이드로 해결되었습니다. 더욱이, 우리는 계통 발화, 집단 유전 및 바코딩 연구를 위한 잠재적인 분자 마커가 될 수 있는 12개의 고변이 지역을 확인하였습니다. 전반적으로, 본 연구는 Rubus의 플라스토믹 구조와 염기서열 분산에 대한 통찰을 제공하여, 이 속의 식별, 진화 및 계통 발전에 대한 향후 연구에 유익할 것입니다.
Lu et al. (Thu,)은 이 문제를 연구했습니다.