Las branquias y la microbiota de la piel de cinco especies de peces pelágicos del océano Atlántico

Resumen: La microbiota y microbioma de las branquias y la piel de los peces salvajes siguen siendo mucho menos investigados en comparación con los de las especies de peces de cultivo, a pesar de que estas interacciones entre animales y microbios tienen los mismos roles ecofisiológicos en ambos casos. En este estudio, se investigaron los perfiles de microbiota bacteriana de las branquias y la piel y sus presuntos metabolismos bacterianos en cinco peces de mar abierto: atún de aleta larga (Auxis sp.), dorado común (Coryphaena hippurus), listón atlántico (Euthynnus alletteratus), bonito atlántico (Sarda sarda) y marlín blanco atlántico (Tetrapturus albidus). Se recolectaron tejidos de branquias y piel de dos a tres individuos por especie, de especímenes capturados por pesca recreativa durante el verano de 2019 y se analizó la diversidad genética del gen 16S rRNA bacteriano mediante secuenciación de alto rendimiento. Las comunidades bacterianas de las branquias entre las cinco especies eran claramente diferentes, pero no la microbiota bacteriana de la piel. Las unidades taxonómicas operacionales dominantes pertenecían a las familias Moraxellaceae, Pseudomonadaceae, Rhodobacteraceae, Staphylococcaceae y Vibrionaceae. A pesar de las diferencias en la composición taxonómica, los presuntos metabolismos entre las branquias y la piel de los cinco peces investigados aquí eran ≥ 94% y estaban dominados por metabolismos básicos, lo que probablemente refleja la exposición continua de estos tejidos al agua de mar circundante.