전유전체 재서열 분석을 통해 유추한 돼지 domestication 동안 선택된 복제 수 변이

자연적 및 인위적 선택의 오랜 기간 동안 중국은 수많은 특별한 돼지 품종을 개발해 왔습니다. 이러한 품종의 유전자원을 이해하는 것은 보존 및 활용에 매우 중요합니다. 많은 연구가 단일 뉴클레오타이드 다형성(SNP) 분석을 이용해 지역 돼지 유전자원 특성을 조사해 왔지만, 유전자 변이의 또 다른 중요한 유형인 복제 수 변이(CNV)는 돼지 자원 이해에 있어서 덜 탐구되었습니다. 본 연구에서는 평균 깊이 12.61을 가진 전유전체 재서열 분석 데이터를 사용하여 18마리의 완베이 돼지(WBP)의 CNV를 조사하였습니다. 우리는 WBP에서 총 8,783개의 CNV(~30.07 Mb, 돼지 유전체의 1.20%)를 확인하였으며, 여기에는 8,427개의 결실과 356개의 중복이 포함되었습니다. 고정 지수(Fst)를 활용하여, 164개의 CNV가 Fst 값의 상위 1% 내에 속하며 선택된 것으로 정의하였습니다. 이러한 선택된 CNV와 관련된 유전자에 대한 기능적 풍부도 분석 결과, 생식( SPATA6 , CFAP43 , CFTR , BPTF ), 성장 및 발달( NR6A1 , SMYD3 , VIPR2 ), 면역( PARD3 , FYB2 )과 관련된 유전자들이 나타났습니다. 본 연구는 완베이 돼지의 유전체 특성에 대한 이해를 증진시키고, 이 품종의 미래 번식을 위한 이론적 기초를 제공합니다.