La degradación de mRNA acoplada a la traducción es una función de características tanto estructurales como a nivel de codones

Resumen La mayoría de la degradación de mRNA ocurre co-traduccionalmente. Varios trabajos en el pasado elucidaron el papel de la composición de codones en la regulación de la degradación co-traduccional de mRNA. La integración de la secuencia de mRNA, la estructura y la densidad ribosomal desvela factores regulatorios comunes de la traducción y la degradación y ayuda a comprender la intrincada asociación entre estos dos procesos importantes. La degradación co-traduccional es un proceso de dos pasos, que involucra la detención de la traducción y la liberación de mRNA para la degradación. Nuestros hallazgos destacan el papel del Índice de Adaptación de Codones, una característica a nivel de secuencia que sirve como el principal determinante de las tasas de traducción facilitando la liberación del transcript en la maquinaria de traducción al detenerse. Concurrentemente, las endonucleasas celulares que atacan segmentos internos desestructurados facilitan la degradación fácil de los transcriptos de mRNA detenidos, influyendo en sus vidas medias a lo largo del genoma y a través de escalas de tiempo evolutivas.