Resumo Fusões gênicas são uma classe de importantes motores oncogênicos, com muitas terapias-alvo aprovadas pela FDA correspondentes em múltiplos tumores sólidos. No entanto, a prevalência de fusões varia consideravelmente por tipo de câncer e teste. A detecção de fusões é tecnicamente desafiadora, e estudos mostraram que o sequenciamento de nova geração (NGS) baseado em RNA pode melhorar as taxas de detecção de fusões quando utilizado em conjunto com NGS baseado em DNA. Neste estudo, realizamos uma análise retrospectiva pan-câncer de 67.278 pacientes recebendo NGS de RNA e DNA em 43 tipos distintos de câncer de tumores sólidos, incluindo: NSCLC (18,6%), câncer colorretal (18,2%) e câncer de mama (13,1%). Nesta coorte, 1497 pacientes (2,2%) apresentaram pelo menos uma das nove fusões detectadas — cada uma tendo uma terapia correspondente aprovada pela FDA em pelo menos uma indicação. Trezentos e dezesseis pacientes (21,1%) tiveram uma fusão detectada (RET ou NTRK1/2/3) com terapia-alvo correspondente aprovada em todas as indicações de câncer. O NGS combinado de RNA e DNA aumentou a detecção de fusões gênicas motoras em 21% em comparação com NGS de DNA isoladamente. Fusões gênicas foram observadas em uma gama de cânceres além de suas indicações de câncer aprovadas: das 1.501 fusões detectadas, 29% (n=437) foram detectadas fora de uma indicação aprovada pela FDA. Finalmente, motores de fusão emergentes com alvos em desenvolvimento de medicamentos foram encontrados em mais 218 pacientes, com o NGS combinado de RNA e DNA aumentando a detecção dessas variantes em 127%. Nossas descobertas apoiam a combinação de NGS de RNA e DNA para maximizar a detecção de fusões clinicamente acionáveis com terapias correspondentes aprovadas pela FDA, e fusões potencialmente acionáveis em indicações não aprovadas pela FDA ou aquelas correspondentes a terapias em desenvolvimento clínico.
Gai et al. (Quar,) estudaram esta questão.