BigWig 및 BigBed: 대규모 분산 데이터셋 탐색 가능

초록 요약: BigWig 및 BigBed 파일은 여러 해상도의 데이터를 포함하는 압축된 이진 색인 파일로, UCSC Genome Browser에서 차세대 염기 서열 실험 결과의 고성능 디스플레이를 가능하게 합니다. 이 시각화는 웹 기반 프로토콜 및 Linux 및 UNIX 운영 체제 파일, R 트리 및 다양한 색인 작성 및 압축 기술의 특정 기능을 활용하는 여러 계층의 소프트웨어 접근 방식을 사용하여 구현됩니다. 그 결과, 전체 파일이 아닌 현재 브라우저 보기에서 필요한 데이터만 전송되어 대규모 분산 데이터 세트에 대한 빠른 원격 액세스를 가능하게 합니다. 가용성 및 구현: BigWig 및 BigBed 생성 및 구문 분석 유틸리티의 바이너리는 http://hgdownload.cse.ucsc.edu/admin/exe/linux.x86₆4/에서 다운로드할 수 있습니다. 생성 및 시각화 소프트웨어의 소스 코드는 비상업적 용도로 http://hgdownload.cse.ucsc.edu/admin/jksrc.zip에서 자유롭게 사용할 수 있으며, C로 구현되어 Linux에서 지원됩니다. UCSC Genome Browser는 http://genome.ucsc.edu에서 이용 가능합니다. 연락처: ann@soe.ucsc.edu 보충 정보: BigWig 및 BigBed 파일 형식의 보충 바이트 수준 세부정보는 Bioinformatics 온라인에서 확인할 수 있습니다. UCSC 데이터 파일 형식 및 사용자 정의 트랙에 대한 심층 설명은 http://genome.ucsc.edu/FAQ/FAQformat.html 및 http://genome.ucsc.edu/goldenPath/help/hgTracksHelp.html를 참조하십시오.