抄録 背景: 乳腫瘍の微小環境はmiRNAによって影響を受け、これらはがんのサブタイピング、検出および治療のバイオマーカーとして機能し得る。しかし、TNBC分子サブタイプにおける微小環境とmiRNAの関係は十分に解明されていない。我々は、サブタイプ特異的な細胞の集積パターンがあり、その異質性は免疫調節および間質調節miRNAの発現多様性に反映されるという仮説を立てた。方法: TCGA、METABRIC、およびGSE31519コホートの正規化遺伝子発現データを解析した。TCGAから正規化miRNAシーケンスデータ(ppm)を取得した。TNBCTypeを用いて症例をbasal-like 1(BL1)、basal-like 2(BL2)、luminal androgen receptor(LAR)、およびmesenchymal(M)に分類した。XCell 2.0で免疫および間質の濃度を算出し、TCGAでは正規化miRNA結果をXCell結果と相関解析で統合した。RでKruskal-Wallis検定、ボンフェローニ補正、Dunn検定を実施した。結果: コホート合計で(n=1038; 検証n=195)、TNBCサブタイプは間質(p<0.000001)、免疫(p<0.00001)、微小環境スコア(p=2.59e-8)において異質性を示した。BL1ではCD8+ T細胞、NK細胞、樹状細胞が豊富であった。BL2は上皮細胞、好中球、およびM2様マクロファージが増加した(p<0.01)。MサブタイプはT細胞が少なく、間葉系間質細胞が多かった。LARはB細胞(p<0.01)および形質細胞が豊富であった。TCGAコホート(n=175)では、13/15の検査細胞型で構成成分の違いが認められた:脂肪細胞、血管内皮、CD8+ T、CD4+ T、M1およびM2マクロファージ、NK、B、樹状細胞、好中球、単球、肥満細胞(すべてp<0.001)、線維芽細胞(p=0.008)。17種類のプロファイル済みmiRNA中12種でサブタイプ間に発現差があり、miR-10b、miR-146a/b、miR-155、miR-181a-1/2、miR-222、miR-223(すべてp<0.001)、miR-27a(p=0.003)を含む(表)。miR-155およびmiR-146a/bは免疫スコア、CD8+ T細胞、M1マクロファージと正の相関を示した。miR-146aはBL1でMより高く発現し、miR-146aの上皮間葉転換(EMT)抑制因子としての役割と一致した。BL2での高miR-146a/b発現は炎症調節を反映し、Mでの低発現はEMTを可能にする可能性がある。BL1での高miR-155発現は免疫豊富な表現型と一致した。EMT促進因子であるmiR-181a-1およびmiR-181a-2はMで上昇し、BL2での高miR-222およびmiR-223発現は免疫増強と相関した。miR-200a/bレベルはサブタイプ間で有意差がなく、彼らの共有される上皮的特徴と一致した。結論: 最大規模の公開miRNA-seqデータセットを用いた本研究は、TNBC微小環境への新たな機構的洞察を提供し、有望なmiRNAバイオマーカー(BL1向けmiR-146a、BL2向けmiR-146bおよびmiR-222、BL1/2向けmiR-3615、LAR向けmiR-10b、M向けmiR-181a/b、M低発現のmiR-223(表))を明らかにし、診断および治療への応用可能性を示した。引用形式: S. M. Sengupta, B. Maiti. 統合された腫瘍微小環境プロファイリングにより、トリプルネガティブ乳がん(TNBC)分子サブタイプ間で異なる免疫、間質およびマイクロRNAシグネチャーを明らかにした抄録。In: Proceedings of the San Antonio Breast Cancer Symposium 2025; 2025 Dec 9-12; San Antonio, TX. Philadelphia (PA): AACR; Clin Cancer Res 2026;32(4 Suppl):Abstract nr PS3-12-04.
Senguptaら(火曜日)はこの課題を研究した。