DIANA-LncBase: 実験的に検証されたおよび計算により予測されたマイクロRNAの長い非コーディングRNAのターゲット

最近、研究コミュニティは長い非コーディングRNA（lncRNA）とその生理的/病理的な影響に注目しています。実験の数が急速に増加し、転写ユニットがより良くアノテーションされるにつれて、lncRNAの特性と機能をインデックスするデータベースは、このプロセスに不可欠なツールとなっています。DIANA-LncBase（www.microrna.gr/LncBase）の目的は、研究者の試みを強化し、マイクロRNA（miRNA）-lncRNAの推定機能的相互作用を解明することです。この研究は、lncRNA上のmiRNAターゲットの包括的なアノテーションを初めて提供します。DIANA-LncBaseは、ヒトおよびマウスのlncRNA上において実験的に検証されたおよび計算により予測されたmiRNA認識要素（MRE）を収容しています。行われた分析には、利用可能なほとんどのlncRNAリソース、関連する高スループットHITS-CLIPおよびPAR-CLIPの実験データ、および最新のin silicoターゲット予測の統合が含まれます。DIANA-LncBaseで利用可能な実験的に支持されているエントリは>5000の相互作用に対応し、計算により予測された相互作用は1000万を超えています。DIANA-LncBaseは、外部リンク、トランスクリプトのゲノム位置のグラフィックプロット、結合部位の表示、lncRNAの組織発現、MREの保存状態および予測スコアなど、各miRNA-lncRNAペアの詳細な情報をホストしています。