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Freezing samples prior to DNA extraction reduces the detection of Gram-negative bacteria in the ocular surface microbiome. Novelty: ClaimNovelty.NOVEL_FINDING. Consensus alignment: ConsensusAlignment.NEUTRAL.

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Ziel dieser Forschung ist es, zu beurteilen, wie das Einfrieren von Proben die Zusammensetzung des Mikrobioms der Augenoberfläche beeinflusst.

March 5, 2026Open Access

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Eine vorläufige Untersuchung zum Einfluss der Probenlagerung auf das wenig verbreitete Mikrobiom der Augenoberfläche

JRJérémy RotzetterUniversity of Bern LSLivia A. SpörriUniversity Hospital of Bern EHElio L. HerzogUniversity of Bern

Key Points

Ziel dieser Forschung ist es, zu beurteilen, wie das Einfrieren von Proben die Zusammensetzung des Mikrobioms der Augenoberfläche beeinflusst.
Untersuchung des Einflusses des Einfrierens von Proben auf die Effekte der DNA-Extraktion.
Analyse eines kleinen Probenumfangs von sechs Proben der Augenoberfläche.
Vergleich gefrorener Proben mit direkt verarbeiteten Proben.
Gefrorene Proben zeigten eine reduzierte Erkennung von gramnegativen Bakterien.
Unterschiede in der Zusammensetzung des Mikrobioms wurden zwischen den Verarbeitungsmethoden beobachtet.

Abstract

In dieser Studie wurde der Einfluss der Probenlagerung durch Einfrieren vor der DNA-Extraktion an einem kleinen Probenumfang (n = 6) untersucht, um festzustellen, ob dies die Zusammensetzung des Mikrobioms der Augenoberfläche – einer Umgebung mit geringer Biomasse – beeinflusst. Gefrorene Proben wiesen eine reduzierte Erkennung von gramnegativen Bakterien im Vergleich zu direkt verarbeiteten Proben auf.

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Eine vorläufige Untersuchung zum Einfluss der Probenlagerung auf das wenig verbreitete Mikrobiom der Augenoberfläche

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