要約 背景: 最近の画期的な新補助的免疫チェックポイントブロックade (NICB) に関するメラノーマの臨床試験は、治癒を目的とした手術の前にICBを投与することが転移性メラノーマおよびそれ以外の新たな標準治療になることを決定的に示しました。放射線画像から病理学的反応評価へのパラダイムシフトは、反応のメカニズムやバイオマーカーを解明し、手術後の個別化治療の決定を導くための豊富な“治療中”の組織を取得するための比類のない「機会の窓」を提供しています。これまでに、単一細胞/バルクRNA研究は、TCF7+幹細胞様CD8+ T細胞および二次リンパ構造 (TLS) がICB反応のポジティブな予測因子であることを示しました。しかし、これらの免疫細胞が新補助的腫瘍微小環境の空間的コンテキスト内でどのように組織され、コミュニケーションをとるかは十分に理解されていません。方法: 私たちは、ステージIIIの転移性メラノーマ患者87名からの91件のFFPEバイオスペシメンのユニークなコホートを調査しました。これには、60名がNICBで治療され（31名が完全反応、7名が部分反応、22名が非反応）、27名が治療経験のない患者が含まれます。この豊かなデジタル資源のために、私たちは、マルチプレックスエラーロバスト蛍光in situハイブリダイゼーション（MERFISH）やFFPEブロックの単一細胞シーケンシング、マルチプレックスIFなどの最先端技術を展開しました。重要なことに、これらの厳しい高次元空間データセットを分析するために、空間的受容体-リガンド (R-L) 相互作用のスケーラブルな定量化手法であるSCIRA、単一細胞空間データにおける生殖中心 (GC)/TLS構造を検出するためのグラフベースのクラスタリング手法であるGC-SCAN、および自動GC/TLS検出のためのエンドツーエンドAIアルゴリズムであるPathNetの3つの新しい計算アルゴリズムを開発しました。
Liu et al. (2026) はこの問題を研究しました。