La estocasticidad restringida por los efectos deterministas de la dieta y la edad impulsa la dinámica de ensamblaje del microbioma del rumen

Cómo se ensamblan comunidades complejas a lo largo de la vida del animal y cuán predecible es el proceso sigue sin explorarse. Aquí, investigamos las fuerzas que impulsan el ensamblaje de microbiomas del rumen a lo largo de la vida de una vaca, con énfasis en el equilibrio entre procesos estocásticos y deterministas. Analizamos el desarrollo del microbioma del rumen desde el nacimiento hasta la adultez utilizando datos de secuenciación de amplicones de 16S-rRNA y encontramos que los animales compartían un grupo de especies sucesionales centrales que invadieron tempranamente y persistieron hasta la adultez. Junto con factores deterministas, como la edad y la dieta, las especies que llegaron temprano ejercieron fuertes efectos de prioridad, de modo que la dinámica de los taxones sucesionales tardíos dependía en gran medida de la composición del microbioma en las primeras etapas de la vida. Los efectos de prioridad también se manifiestan como cambios dramáticos en la dinámica de desarrollo del microbioma entre animales nacidos por cesárea frente a aquellos nacidos de forma natural, siendo los primeros los que experimentaron una invasión de especies mucho más rápida y un desarrollo del microbioma acelerado. En general, nuestros hallazgos muestran que, junto con fuertes restricciones deterministas impuestas por la dieta y la edad, la colonización estocástica en la primera infancia tiene impactos duraderos en el desarrollo de los microbiomas animales.