번역에서 신장 사건과의 d-아미노산 호환성 재평가

D-아미노산의 번역 중 펩타이드 신장과의 호환성은 여러 연구에서 조사되었습니다. 그러나 일부 연구에서는 D-아미노산이 번역과 호환되지 않는다고 보고한 반면, 다른 연구에서는 D-아미노산이 폴리펩타이드에 포함된다고 보고했습니다. 여기에서는 유연한 시험관 내 번역(FIT) 시스템을 사용하여 재프로그래밍된 유전 코드를 가진 짧은 펩타이드의 신생 사슬에 D-아미노산 시리즈의 도입을 재평가했습니다. FIT 시스템은 잠재적인 경쟁자가 없는 상태에서 각 D-아미노산의 신장과의 호환성을 정량적으로 평가할 수 있게 해줍니다. 도입 효율성은 Tricine-SDS-PAGE에 의해 결정되었고 전체 길이의 펩타드는 MALDI-TOF-MS에 의해 검출되었습니다. D-아미노산은 해당 L-아미노산에 대한 도입 효율성을 기준으로 세 그룹으로 분류되었습니다. 그룹 I의 D-아이소머는 40% 이상의 효율성을 보였으며(알라닌, 세린, 시스틴, 메티오닌, 트레오닌, 히스티딘, 페닐알라닌, 그리고 티로신), 그룹 II는 10-40%의 효율성을 보였습니다(아스파라긴, 글루타민, 발린, 그리고 류신). 그룹 III의 D-아미노산은 절단된 펩타이드나 감지 가능한 전체 길이의 펩타드를 생성하지 않았습니다(아르기닌, 리신, 아스파르트산, 글루탐산, 이소류신, 트립토판, 그리고 프로린). 그룹 I의 D-아미노산을 연속적으로 사용하거나 L-아미노산과 번갈아 사용할 경우, 이는 그들의 신장을 완전히 억제했습니다. 그러나 D-아미노산 사이에 두 개 또는 세 개의 L-아미노산이 삽입되면 이중 도입 효율성이 회복되었습니다. 우리의 결과는 D-아미노산과 펩타이드 신장의 호환성을 정량적으로 드러내고 D-아미노산의 선택 및 리보솜에 의한 도입 메커니즘에 대한 새로운 질문을 제기합니다.