SH3 도메인에 의한 아밀로이드 섬유 형성

SH3 도메인은 많은 단백질에서 발견되는 간단한 구조를 가진 잘 특징화된 소형 단백질 모듈입니다. 산성 pH에서, 소의 포스파티딜이노시톨 3-키나제의 p85alpha 서브유닛의 SH3 도메인(PI3-SH3)은 전자 현미경, 콩고 레드 결합 분석 및 X선 섬유 회절로 평가된 전형적인 아밀로이드 섬유로 구성된 젤을 천천히 형성합니다. 섬유가 생성되는 산성 pH에서의 PI3-SH3의 용해 형태(다양한 기법에 의해 A 상태로 알려짐)가 특징화되었습니다. Far- 및 near-UV 영역의 원형 이색성 및 1H NMR은 A 상태가 중성 pH에서 고유 단백질에 비해 상당히 풀린 상태임을 나타냅니다. 그러나 NMR 확산 측정 결과 A 상태의 효과적 유체역학적 반경이 고유 단백질보다 23%만큼 더 크고 3.5 M 구아니딘 염화물로 변성된 단백질보다 20% 더 작다는 것을 나타냅니다. 또한, A 상태는 소수성 염료인 1-아닐리논프탈레인-8-술폰산과 결합하여, 이 상태에서 SH3가 부분적으로 형성된 소수성 핵을 가지고 있음을 시사합니다. 이러한 결과는 A 상태가 부분적으로 접혀 있으며 용액에서 형성된 부분적으로 접힌 상태가 아밀로이드 침착의 전구체라는 가설을 지지합니다. 더불어, 이 도메인이 아밀로이드 섬유로 응집된다는 것은 아밀로이드 침착의 가능성이 질병과 관련된 몇몇 단백질뿐만 아니라 단백질의 공통 속성일 수 있음을 나타냅니다.