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La activación de genes específicos de tejido que normalmente están silenciosos y la "crisis de identidad" celular resultante son las consecuencias inexploradas de la reprogramación epigenética maligna. Diseñamos una estrategia para investigar esta reprogramación, que consistió en identificar un gran número de genes restringidos a tejidos que están epigenéticamente silenciados en células somáticas normales y luego detectar su expresión en el cáncer. Este enfoque llevó a demostrar que las activaciones génicas "fuera de contexto" a gran escala ocurren sistemáticamente en una variedad de tipos de cáncer. En nuestra serie de 293 tumores de pulmón, identificamos una firma de expresión génica ectópica asociada con un subconjunto de tumores altamente agresivos, que predijo mal pronóstico independientemente de la etapa TNM (tamaño del tumor, positividad de nodos y metástasis) o subtipo histológico. La capacidad de aislar estos tumores nos permitió revelar sus características moleculares comunes caracterizadas por la adquisición de perfiles de expresión génica de células madre embrionarias/células germinales y la regulación a la baja de genes de respuesta inmune. El reconocimiento metódico de las activaciones génicas ectópicas en células cancerosas podría servir como base para la estratificación de tumores guiada por firmas génicas, así como para el descubrimiento de mecanismos oncogénicos, y expandir la comprensión de la biología de tumores muy agresivos.
Rousseaux et al. (Wed,) estudiaron esta cuestión.