Key points are not available for this paper at this time.
يوفر البروتينوم رؤى فريدة حول بيولوجيا الأمراض تتجاوز الجينوم والترنسكربتوم. وقد أدى نقص مجموعات البيانات الكبيرة للبروتينات إلى تقييد تحديد علامات الأورام الجديدة. هنا، يتم تحليل البروتينات لـ 949 خط خلايا سرطانية عبر 28 نوعًا من الأنسجة باستخدام مطيافية الكتلة. من خلال نشر سير عمل لت quantification 8,498 بروتين، تلتقط هذه البيانات دليلًا على تعديلات الخلايا ونقل ما بعد النسخ. يكشف دمج متعدد الأومكس، استجابة الأدوية، واختبارات أهمية الجينات باستخدام CRISPR-Cas9 مع خط أنابيب قائم على التعلم العميق عن آلاف من علامات البروتين لثغرات السرطان التي ليست ذات دلالة عند مستوى النسخ. إن قوة البروتينوم في توقع استجابة الأدوية مشابهة جدًا لتلك الخاصة بالترنسكربتوم. علاوة على ذلك، فإن تقليل عدد البروتينات بشكل عشوائي إلى 1,500 بروتين يؤثر بشكل محدود على القوة التنبؤية، مما يتماشى مع كون شبكات البروتين مترابطة بشدة وتعمل بشكل مشترك. هذه الخريطة الشاملة للبروتينات السرطانية (ProCan-DepMapSanger) هي مصدر شامل متاح على https://cellmodelpassports.sanger.ac.uk.
درس غونسالفيس وآخرون (الخميس) هذا السؤال.