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Die Manipulation von pflanzenassoziierten Mikroben zur Reduzierung von Krankheiten oder zur Verbesserung der Ernteerträge erfordert ein umfassendes Verständnis der Wechselwirkungen im Phytobiom. Pflanzen wurden an einem Standort mit einer Weizen/Mais/Sojabohnen-Fruchtfolge entnommen, an dem vier verschiedene Bewirtschaftungsstrategien umgesetzt werden. Wir analysierten die Pilz- und Bakteriengemeinschaften von Blättern, Stängeln und Wurzeln von Weizen während der Wachstumsperiode mittels 16S- und Pilz-Internen Transkriptionseinheit 2 rRNA-Gen-Amplikon-Sequenzierung. Die am häufigsten vorkommenden operativen taxonomischen Einheiten (OTUs) wurden in allen Proben geteilt, obwohl die Werte der OTUs mit niedriger Häufigkeit variierten. Endophyten wurden aus Pflanzen isoliert und auf antagonistische Aktivität gegenüber dem Weizenpathogen Fusarium graminearum getestet. Antagonistische Stämme wurden auf pflanzenschützende Aktivität in Sämlingsassays bewertet. Unsere Ergebnisse deuten darauf hin, dass mikrobielle Gemeinschaften stark von der Pflanzenorgane und dem Pflanzenalter beeinflusst wurden und möglicherweise von der Bewirtschaftungsstrategie beeinflusst werden können.
Gdanetz et al. (Sun,) haben diese Frage untersucht.