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체크포인트 억제제(CPIs)는 적응 면역을 증대시킵니다. 체계적인 범종양 분석은 CPI 감작을 뒷받침하는 종양 세포 고유 및 미세 환경적 특징의 상대적 중요성을 밝혀낼 수 있습니다. 여기에서 우리는 표준화된 생물정보학 작업 흐름과 임상 결과 기준을 활용하여 CPI 치료를 받은 1,000명 이상의 환자에 대한 전체 엑솜 및 전사체 데이터를 수집하여 CPI 감작의 다변량 예측 변수를 검증했습니다. 클론 종양 돌연변이 부담(TMB)은 CPI 반응의 가장 강력한 예측 변수였으며, 그 다음은 총 TMB와 CXCL9 발현이었습니다. 하위 클론 TMB, 체세포 복제 변화 부담, 그리고 조직 적합성 백혈구 항원(HLA) 진화적 이탈은 범암의 중요성을 달성하지 못했습니다. 이핵산 변이는 급진적인 아미노산 치환 및 향상된 펩타이드 소수성/면역원성과 관련된 면역원적 에피토프의 원천으로 확인되었습니다. 복제 수 분석은 이전의 기능적 증거에 의해 지지되는 CPI 결과의 두 가지 추가 결정 요인을 밝혔습니다: 반응과 관련된 9q34(TRAF2) 손실과 저항성과 관련된 CCND1 증폭. 마지막으로, 클론 신항원 반응성 CD8 종양 침윤 림프구(TILs)의 단일세포 RNA 시퀀싱(RNA-seq)과 CPI 반응 종양의 대량 RNA-seq 분석결합하여 CCR5 및 CXCL13을 CPI 민감성의 T 세포 고유 마커로 확인했습니다.
Litchfield et al. (수요일) 이 질문을 연구했습니다.