Diversidad bacteriana en un lago ártico: un clúster de SAR11

Utilizamos técnicas moleculares para evaluar la afinidad filogenética de microorganismos cultivados y no cultivados del Lago Toolik, un lago oligotrófico en el ártico de Alaska, EE. UU. Las posiciones filogenéticas de las culturas de bacterias clonadas se determinaron mediante análisis de secuencias de genes de ARN ribosómico amplificados por PCR. Los aislados bacterianos del Lago Toolik mostraron un alto grado de similitud, 0.94 a 0.99, con una amplia variedad de phyla que están bien representados en la base de datos de ARN ribosómico. La aparición de especies normalmente asociadas con un hábitat terrestre (Arthrobacter globiformis y Burkholderia solanacearum) o un ambiente más rico en nutrientes (Cytophaga aquatilis y Zoogloea ramigera) sugiere un origen asociado a partículas para estos tipos celulares, consistente con el hecho de que usamos una muestra sin filtrar. En contraste, el análisis de genes de ARN r clonados de una comunidad de ADN natural compleja indicó la predominancia de beta-proteobacterias estrechamente relacionadas con el grupo de homología de ARN r II pseudomonas Alcaligenes eutrophus y Pseudomonas pickettii. Sin embargo, 2 de los clones de genes de ARN r son parientes de rama profunda (similaridad = 0.88) del clúster de alpha-proteobacteria SAR11, detectado previamente solo en ambientes marinos. Este hallazgo indica una distribución acuática generalizada para este grupo recientemente descrito. PALABRAS CLAVE: Bacteria 16 s rRNA. Ártico. SAR11.