Reconocimiento de estructura de ARN amplio y adaptable por la proteína de repetición tetratricopeptídica inducida por interferón humano IFIT5

Las respuestas de interferón (IFN) juegan papeles clave en la defensa celular contra patógenos. Se propone que las proteínas inducidas por IFN, altamente expresadas y con repeticiones de tetratricopeptidos (IFITs), funcionen como proteínas de unión al ARN, pero las especificidades de unión y discriminación de ARN de las proteínas IFIT siguen siendo poco claras. Aquí mostramos que IFIT5 humano tiene una afinidad comparable por ARN con diversos extremos 5' que contienen fosfato, excluyendo la capa de ARN mensajero de eucariotes superiores. La mutagénesis sistemática reveló que las sustituciones de secuencia en IFIT5 pueden expandir alternativamente o introducir sesgo en la unión de proteínas a ARN con monofosfato 5', trifosfato, cap0 (N7-metilguanosina puenteada por trifosfato) o cap1 (cap0 con metilación 2'-O del ARN). Definimos la amplitud de los ligandos celulares para IFIT5 utilizando una transcriptasa inversa de intrón grupo II termostable para la secuenciación de ARN. Mostramos que IFIT5 se une a tARNs precursores y procesados, así como a otros transcritos de ARN polimerasa III. Nuestros hallazgos establecen la especificidad de reconocimiento de ARN de la proteína de respuesta inmune innata humana IFIT5.