Factores asociados con la diversificación de las comunidades microbianas intestinales en chimpancés del Parque Nacional Gombe

El tracto gastrointestinal alberga grandes y diversas poblaciones de bacterias que varían entre individuos y dentro de los individuos a lo largo del tiempo. Numerosos factores internos y externos pueden influir en el contenido de estas comunidades microbianas, incluyendo la dieta, la geografía, la fisiología y el grado de contacto entre los hospedadores. Para investigar las contribuciones de tales factores a la variación y cambios en las comunidades microbianas intestinales, analizamos la microbiota intestinal distal de chimpancés individuales de dos comunidades en el Parque Nacional Gombe, Tanzania. Estas muestras, que se derivaron de 35 chimpancés, muchos de los cuales han sido monitoreados durante múltiples años, proporcionan una profundidad longitudinal inusualmente completa para individuos de relaciones genéticas conocidas. Aunque se ha demostrado que la composición de la microbiota de grandes simios se codiversifica con las especies hospedadoras, lo que indica que la genética y la filogenia del hospedador han jugado un papel importante en su diferenciación a lo largo de escalas temporales evolutivas, las relaciones genealógicas de los chimpancés individuales no coincidieron con la similitud en sus comunidades microbianas intestinales. Sin embargo, los habitantes de comunidades de chimpancés adyacentes podían ser distinguidos en función del contenido de su microbiota intestinal. A pesar de la amplia similitud de los miembros de la comunidad, como se esperaría de una dieta compartida o interacciones, los inmigrantes a largo plazo en una comunidad a menudo albergaban la microbiota intestinal más distintiva, lo que sugiere que los individuos retienen características de sus comunidades microbianas intestinales anteriores durante períodos prolongados. Este patrón se reforzó en varios chimpancés muestreados a lo largo de escalas temporales largas, en los cuales los principales constituyentes de la microbiota intestinal se mantuvieron durante casi una década.