A acessibilidade do DNA promotor não é o principal determinante da regulação gênica mediada por cromatina

A acessibilidade do DNA é considerada de grande importância na regulação da expressão gênica. Testamos esta hipótese usando uma enzima de restrição como um probe da estrutura da cromatina e como um proxy para fatores de transcrição. Medimos a taxa de digestão e a fração de DNA acessível em quase todos os locais genômicos de AluI em leveduras em brotação e núcleos de fígado de camundongo. O DNA de hepatócitos é mais acessível do que o DNA de leveduras, consistente com espaçamentos maiores entre nucleossomos, sugerindo que o espaçamento de nucleossomos é um determinante importante da acessibilidade. A acessibilidade do DNA varia de célula para célula, de maneira que essencialmente nenhum local é acessível ou inacessível em cada célula. Locais de AluI em promotores inativos de camundongo são acessíveis em algumas células, implicando que fatores de transcrição poderiam se ligar sem ativar o gene. A eucromatina e a heterocromatina têm acessibilidades muito semelhantes, sugerindo que fatores de transcrição podem penetrar na heterocromatina. Assim, a acessibilidade do DNA provavelmente não é o principal determinante da regulação gênica.