Analyse de l'ADN environnemental aérien comme outil de surveillance du commerce d'oiseaux vivants

RÉSUMÉ Le commerce mondial d'oiseaux vivants est vaste, impliquant à la fois des exportations internationales et un commerce national à grande échelle. Malgré les réglementations internationales, le commerce de certaines espèces inscrites à la CITES reste largement non documenté et illégal. Les marchés des oiseaux chanteurs sont difficiles à surveiller, et les enquêtes conventionnelles sont limitées par un expertise taxonomique restreinte et la dissimulation délibérée des espèces commercialisées illégalement. Ici, nous explorons l'analyse de l'ADN environnemental aérien (eDNA) comme un nouvel outil pour détecter les espèces d'oiseaux et évaluer son potentiel pour la surveillance du commerce aviaire. Nous avons collecté des échantillons aériens dans des environnements de marché fermés et ouverts, accompagnés de relevés visuels, et les avons traités à l'aide de techniques d'extraction d'ADN et de métabarcodage pour identifier les taxons aviaires. Dans les environnements fermés, trois des six espèces présentes ont été systématiquement détectées lors de tous les jours d'échantillonnage, les trois autres probablement détectées mais attribuées à des espèces étroitement liées, démontrant une grande précision dans des conditions contrôlées. Dans les marchés ouverts, l'analyse eDNA a capturé environ 20 % des espèces observées visuellement avec des séquences de référence disponibles, et la probabilité de détection augmentait avec l'abondance des espèces. Une limitation clé était la large proportion de variantes de séquences d'amplicon (ASVs) qui ne pouvaient pas être attribuées à des espèces, soulignant la nécessité d'élargir les bases de données de référence et d'utiliser plusieurs amorces pour améliorer la détection. Malgré ces défis, nos résultats indiquent que l'analyse eDNA aérienne peut compléter la surveillance conventionnelle, en particulier dans des contextes de commerce fermé tels que les conteneurs de fret. Bien que les applications sur les marchés ouverts rencontrent des contraintes méthodologiques, un raffinement supplémentaire et une intégration avec des enquêtes conventionnelles pourraient permettre une surveillance évolutive et non invasive de la biodiversité aviaire échangée.