Integração da Análise Clínica e Genética da Invasão Perineural em Carcinoma Espinocelular de Cabeça e Pescoço

Introdução: A invasão perineural (IPN), uma característica patológica chave do carcinoma espinocelular de cabeça e pescoço (CEHPC), prevê baixa sobrevida. No entanto, as características clínicas associadas permanecem incertas, e os mecanismos moleculares são em grande parte desconhecidos. Materiais e métodos: Dados de expressão gênica do CEHPC e dados clínicos correspondentes foram baixados do The Cancer Genome Atlas (TCGA). Foi realizada uma análise de subgrupos prognósticos e possíveis fatores de risco de IPN foram avaliados com regressão logística. Módulos de coexpressão gênica associados à IPN foram identificados com análise de rede de coexpressão gênica ponderada (WGCNA), e as funções dos genes principais dos módulos e os papéis de células não malignas na IPN foram avaliados com um conjunto de dados de transcriptômica unicelular (GSE103322). Resultados: A IPN foi significativamente associada inversamente à sobrevida global (HR, 2,08; 95% CI, 1,27 a 3,40; P = 0,004), especialmente em pacientes avançados (HR, 2,62; 95% CI, 1,48 a 4,64; P = 0,017). O WGCNA identificou um módulo de coexpressão significativamente associado à IPN, contendo 357 genes, com 12 genes centrais (TIMP2, MIR198, LAMA4, FAM198B, MIR4649, COL5A1, COL1A2, OLFML2B, MMP2, FBN1, ADAM12 e PDGFRB). A análise de dados de transcriptômica unicelular revelou que os genes no módulo associado à IPN correlacionaram-se com as assinaturas "EMT," "metástase" e "invasão." Entre as células não malignas, os fibroblastos apresentaram expressão relativamente alta dos genes principais. Conclusão: Nos níveis molecular e ômico, verificamos que a IPN no CEHPC é um processo de invasão, em vez de simples difusão. Fibroblastos provavelmente desempenham um papel importante na IPN. Novidade & Declarações de Impacto O estudo é uma análise abrangente da IPN no CEHPC, desde o nível clínico até o nível molecular, e apresenta a primeira descrição da IPN relacionada ao câncer sob a perspectiva ômica até o momento, que sabemos. Verificamos que a IPN no CEHPC é um processo de invasão e não simples difusão, nos níveis molecular e ômico. Os fibroblastos foram encontrados provavelmente desempenhando um papel importante na IPN ao analisar dados de transcriptômica unicelular.