細胞壁酵素をコードする遺伝子ファミリー全メンバーの包括的な発現解析により、アラビドプシスの特定の器官における細胞壁構築に関与するcis-調節領域を予測することができました

アラビドプシス・タリアナのゲノム配列決定プロジェクトは、ゲノムの重複によって生成される多遺伝子ファミリーが動物のゲノムよりも植物のゲノムにおいてより豊富であることを明らかにしました。高等植物における多遺伝子ファミリーの進化的意義を理解するために、植物における細胞壁構築に関与するキシログルカンエンドトランスグルコシラーゼ/ヒドロラーゼをコードする遺伝子群であるXTH遺伝子ファミリーを調べました。このファミリーのすべてのメンバー（33遺伝子）の発現解析を定量的リアルタイムRT-PCRを用いて行ったところ、大多数のメンバーが組織特異性およびホルモン信号への応答において異なる発現プロファイルを示し、一部のメンバーは類似の発現パターンを示しました。各遺伝子の周辺配列を比較することにより、4セットの大規模重複と2セットの孤立遺伝子の重複を特定しました。各遺伝子重複のセットにおいて、1から200塩基対までの長いヌクレオチド配列が保存されています。さらに、遺伝子の重複は類似の器官特異的発現プロファイルを示します。これらの事実により、特に細胞壁構築および形態形成に関連する特定の器官や組織に特異的な推定cis-調節領域を予測することができました。