Die 2,0-Å Auflösung der Kristallstruktur eines trimerschen Antikörperfragments mit nichtkognaten VH–VL-Domain-Paaren zeigt eine Umarrangement von VH CDR3

Die 2,0-Å Auflösung der Röntgenkristallstruktur eines neuartigen trimeren Antikörperfragmentes, eines "Triabody", wurde bestimmt. Der Trimer besteht aus Polypeptiden, die auf die gleiche Weise konstruiert sind wie zuvor für einige "Diabodies" beschrieben: eine VL-Domain, die direkt an das C-Terminus einer VH-Domain fusioniert ist - d.h. ohne eine Linkersequenz. Der Trimer hat drei Fv-Köpfe, wobei die Polypeptide in einer zyklischen, Kopf-zu-Schwanz-Anordnung angeordnet sind. Für die hier berichtete Struktur wurde das Polypeptid mit einer VH-Domain aus einem Antikörper konstruiert, die mit der VL-Domain aus einem nicht verwandten Antikörper fusioniert ist, was "kombinatorische" Fvs bei der Bildung des Trimers hervorruft. Die Struktur zeigt, dass der Austausch der VL-Domain aus Antikörper B1-8, einer Vlambda-Domain, mit der VL-Domain aus Antikörper NQ11, einer Vkappa-Domain, zu einer dramatischen konformationellen Änderung in der VH CDR3-Schleife des Antikörpers B1-8 führt. Der Umfang dieser Änderung ist ähnlich der größten konformationellen Änderungen, die in Antikörperfragmenten als Reaktion auf Antigenbindung beobachtet wurden. Die kombinatorische Paarung von VH- und VL-Domänen stellt einen wesentlichen Bestandteil der Antikörperdiversität dar. Konformationell flexible Antigenbindungsstellen, die in der Lage sind, sich an den spezifischen CDR3-Schleifenkontext anzupassen, der bei der VH-VL-Paarung entsteht, können vom Immunsystem eingesetzt werden, um die strukturelle Diversität der Immunantwort zu maximieren.