Synthese von Phylogenie und Taxonomie zu einem umfassenden Stammbaum des Lebens

Die Rekonstruktion der phylogenetischen Beziehungen, die alle Linien (den Stammbaum des Lebens) vereinen, ist eine große Herausforderung. Die Knappheit an homologen Charakterdaten über unterschiedlich verwandte Linien macht eine direkte phylogenetische Inferenz derzeit unmöglich. Um einen umfassenden Stammbaum des Lebens zu rekonstruieren, haben wir daher veröffentlichte Phylogenien sowie taxonomische Klassifikationen für Taxa, die nie in eine Phylogenie integriert wurden, synthetisiert. Wir präsentieren einen Entwurf des Stammbaums mit 2,3 Millionen Blättern - dem Open Tree of Life. Die Realisierung dieses Baumes erforderte die Zusammenstellung von zwei zusätzlichen Gemeinschaftsressourcen: (i) eine umfassende globale Referenztaxonomie und (ii) eine Datenbank veröffentlichter phylogenetischer Bäume, die dieser Taxonomie zugeordnet sind. Unser Open-Source-Rahmen erleichtert Kommentare und Beiträge aus der Gemeinschaft und ermöglicht es, den Baum kontinuierlich zu aktualisieren, wenn neue phylogenetische und taxonomische Daten digital verfügbar werden. Obwohl die Datenabdeckung und phylogenetische Konflikte im Open Tree of Life Lücken sowohl in den zugrunde liegenden Daten für die phylogenetische Rekonstruktion als auch in der Veröffentlichung von Bäumen als digitale Objekte aufzeigen, bietet der Baum einen überzeugenden Ausgangspunkt für Beiträge aus der Gemeinschaft. Dieser umfassende Baum wird die grundlegende Forschung zur Natur der biologischen Diversität anheizen und letztendlich aktuelle Phylogenien für nachgelagerte Anwendungen in der vergleichenden Biologie, Ökologie, Naturschutzbiologie, Klimawandel, Landwirtschaft und Genomik bereitstellen.