分子ネットワーキングを用いたデレプリケーション戦略

自然産物発見プログラムにおける主要な目標は、複雑な生物抽出物から既知のエンティティを迅速にデレプリケートすることです。ここでは、化学的類似性に基づいてMS/MSデータを整理するアプローチである分子ネットワーキングが、従来のデレプリケーション戦略に強力な補完であることを示しています。分子ネットワークによる成功したデレプリケーションには、天然産物混合物のMS/MSスペクトルと、既知の標準、合成化合物、または十分に特性評価された生物のMS/MSスペクトルをロバストなデータベースに整理して含める必要があります。このアプローチは、異なるイオン化プラットフォームに対応でき、周囲イオン化、直接注入、LCベースの方法からのMS/MSデータの相互相関を可能にします。分子ネットワーキングは複雑な混合物から既知の分子をデレプリケートするだけでなく、関連する類似体も捕捉します。これは多くの他のデレプリケーション戦略にとっての課題です。その有用性をデレプリケーションツールとして示すために、私たちは質量分析に基づく分子ネットワーキングを多様な海洋および陸上微生物サンプルに適用し、類似体を含む58の分子のデレプリケーションを示します。