말라리아 중 Plasmodium falciparum 변이 표면 항원 발현 양상

Plasmodium falciparum에 감염된 적혈구에서 발현되는 변이 표면 항원은 말라리아 면역의 잠재적으로 중요한 표적이며, 적어도 일부는 var 유전자 군에 의해 암호화되며, 모든 기생충 게놈에 약 60개가 존재합니다. 여기에서는 케냐 아동의 12개의 임상 기생충 분리주로부터 var 유전자 발현을 직접 비교하기 위해 짧은 var 유전자 서열 "태그" 내에서 반보존된 영역을 사용합니다. 총 1,746개의 var 클론이 게놈과 cDNA에서 시퀀스화되었고 특정 서열 특징을 사용하여 여섯 개의 서열 그룹 중 하나로 지정되었습니다. 결과는 다음과 같습니다. (1) 각 서열 그룹에 속하는 게놈 클론의 상대적인 수는 기생충 분리주 간에 유사하였으며, 완전히 시퀀스화된 단일 기생충 분리주에서 발견된 유전자 수와 잘 대응하였습니다. 반대로, 각 그룹에 속하는 cDNA 클론의 상대적인 수는 분리주 간에 상당히 달랐습니다. (2) 상대적으로 보존된 그룹에 속하는 서열의 발현은 질병 발생 시 감염된 아동이 지닌 변이 표면 항원 항체의 레퍼토리와 부정적인 연관성이 있었고, 반면 또 다른 그룹에 속하는 서열의 발현은 기생충의 "로제팅" 표현형, 즉 잘 확립된 병원성 결정 인자와 연관이 있었습니다. 우리의 결과는 생체 내에서 숙주-기생충 관계의 상태에 대한 정보가 다양한 var 그룹의 차등 발현 측정을 통해 제공될 수 있으며, 짧은 서열 데이터 조각으로 정의될 수 있음을 제안합니다.