コドンカタログの使用とゲノム仮説

61種類のアミノ酸コドンそれぞれの頻度は、50コドン以上の全ての公開されたmRNA配列において測定されました。各ゲノムの種類および各個別遺伝子について、頻度が示されています。同じまたは類似のゲノムを持つ遺伝子間で、驚くべき一貫性が存在します。したがって、各ゲノム、またはゲノムの種類は、コドンの選択間に「システム」を持っているようです。ただし、フレームシフト遺伝子は、通常の遺伝子とは大きく異なる選択戦略を持っています。我々の研究は、mRNA配列を区別する主な要因は退化塩基の選択に関連していることを示しています。したがって、これらの体系的な第三塩基の選択は、コーディング戦略の違いを反映する新しい種類の遺伝的距離を確立するために使用できます。我々が見つけた選択パターンは、個々の遺伝子ではなくゲノムが自然選択の単位であるという考えと整合性があるようです。ゲノム内の各遺伝子は、その種のコドンカタログの使用に従う傾向があります；これが我々のゲノム仮説です。