تقييم GPT-4 لتوصيف نوع الخلايا في تحليل تسلسل RNA من خلية واحدة

توصيف نوع الخلايا هو خطوة أساسية في تحليل تسلسل RNA من خلية واحدة. ومع ذلك، فهي عملية تستغرق وقتًا طويلاً وغالبًا ما تتطلب خبرة في جمع جينات العلامة الكنسية وتوصيف أنواع الخلايا يدويًا. عادةً ما تتطلب طرق التوصيف الآلي لأنواع الخلايا الحصول على مجموعات بيانات مرجعية عالية الجودة وتطوير خطوط أنابيب إضافية. قمنا بتقييم أداء GPT-4، وهو نموذج لغوي كبير ذو قدرة عالية، لتوصيف نوع الخلايا، وأظهرنا أنه يمكنه توصييف أنواع الخلايا تلقائيًا بدقة من خلال الاستفادة من معلومات جينات العلامة الناتجة عن خطوط أنابيب تحليل RNA من خلية واحدة القياسية. عند تقييمه عبر مئات من أنواع الأنسجة وأنواع الخلايا، يولد GPT-4 توصيلات لأنواع الخلايا تظهر تطابقًا قويًا مع التوصيفات اليدوية ولديه القدرة على تقليل الجهد والخبرة اللازمة لتوصيف نوع الخلايا بشكل كبير. طورنا أيضًا GPTCelltype، حزمة برمجيات R مفتوحة المصدر لتسهيل توصيل نوع الخلايا بواسطة GPT-4.