Conservación y divergencia del patrón de metilación en plantas y animales

La metilación de ADN en citosina es una marca epigenética heredable presente en muchos organismos eucariotas. Aunque la metilación de ADN probablemente tiene un papel conservado en el silenciamiento génico, los niveles y patrones de metilación de ADN parecen variar drásticamente entre diferentes organismos. Aquí utilizamos secuenciación de bisulfito genómico por disparo (BS-Seq) para comparar la metilación de ADN en ocho genomas de plantas y animales diversos. Encontramos que los patrones de metilación son muy similares en plantas con flores, con citosinas metiladas detectadas en todos los contextos de secuencia, mientras que la metilación CG predomina en los animales. Los vertebrados tienen metilación en todo el genoma, excepto en las islas CpG. La metilación en el cuerpo del gen está conservada con una clara preferencia por los exones en la mayoría de los organismos. Además, los genes parecen ser el objetivo principal de la metilación en Ciona y la abeja melífera. Entre los ocho organismos, la alga verde Chlamydomonas tiene el patrón de metilación más inusual, con una metilación no-CG enriquecida en exones de genes en lugar de en repeticiones y transposones. Además, el cofactor Dnmt1 Uhrf1 tiene una función conservada en el mantenimiento de la metilación CG tanto en transposones como en cuerpos de genes en los genomas de ratón, Arabidopsis y pez cebra.