Identification de biomarqueurs glycoprotéiques sérotiques putatifs pour l'adénocarcinome pulmonaire humain par chromatographie d'affinité multilectine et LC‐MS/MS

Les glycoprotéines sérum humaines jouent des rôles fondamentaux dans de nombreux processus biologiques et ont également une valeur clinique en tant que biomarqueurs de la progression de la maladie et du traitement. Dans cette étude, nous avons isolé des glycoprotéines à partir du sérum de trois individus en bonne santé et de trois patients atteints d'adénocarcinome pulmonaire en utilisant la chromatographie d'affinité multilectine. Les glycoprotéines récupérées ont été soumises à un traitement avec de la peptide-N-glycosidase F (PNGase F) et à une digestion in-gel par trypsine. Les peptides trypsiques ont été analysés par nano-LC couplé à ESI-MS/MS et les spectres MS/MS ont été traités par Bioworks 3.2 et un outil bioinformatique interne, ProtAn. Environ 90 % des protéines identifiées contenaient plus d'un site de glycosylation potentiel. La comparaison du glycoprotéome sérique des individus sains et des adénocarcinomes a révélé 38 protéines sélectives au cancer. Parmi celles-ci, 60 % ont été précédemment rapportées comme des protéines à faible abondance dans le sérum humain. Nous avons identifié plusieurs protéines sélectives au cancer qui ont été précédemment caractérisées comme des indicateurs potentiels du cancer du poumon dans le sérum ou le plasma, y compris l'haptoglobine (HP), l'inhibiteur de trypsine inter-alpha chaîne lourde 4 (ITI-H4), le précurseur du complément C3 et la glycoprotéine alpha-2 riche en leucine. De plus, la kallikréine plasmatique (KLKB1) et l'inhibiteur de trypsine inter-alpha chaîne lourde 3 (ITI-H3) ont été identifiés comme étant potentiellement élevés dans le groupe de cancer du poumon et ont été validés par analyse Western blot. En outre, un fragment de protéine de kallikréine plasmatique d'environ 18 kDa a été détecté à des niveaux élevés dans 25 des 28 patients atteints d'adénocarcinome, tandis qu'un des huit individus normaux a montré une positivité modérée. Les résultats suggèrent que KLKB1 représente un candidat potentiel de biomarqueur sérique du cancer du poumon.