Épuisement sélectif de l'ARNr permettant le profilage de l'ensemble du transcriptome des tissus archivés fixés

Nous rapportons une méthode pour l'Épuisement Sélectif des espèces d'ARN abondantes (SDRNA) à partir d'ARN humain total isolé de tissus fixés au formol et inclus dans de la paraffine (FFPE), démontrant ici l'élimination des transcrits ribosomiques et mitochondriaux de l'ARN des tissus FFPE cliniques archivés jusqu'à 20 ans. Il est important de noter que le SDRNA élimine 98 % des ARN ciblés tout en préservant les profils d'abondance relative des ARN non ciblés, permettant l'analyse routinière de l'ensemble du transcriptome des spécimens de tissus archivés cliniquement précieux par séquençage de nouvelle génération.