scRepertoire: एक R-आधारित टूलकिट जो एकल-कोशिका इम्यून रिसेप्टर विश्लेषण के लिए है

एकल-कोशिका अनुक्रमण इम्यूनोलॉजी और ऑन्कोलॉजी के क्षेत्र में एक उभरा हुआ तकनीक है जो शोधकर्ताओं को RNA मात्रात्मकता और अन्य मोडालिटीज, जैसे कि एकल कोशिका के स्तर पर इम्यून सेल रिसेप्टर प्रोफाइलिंग, को जोड़ने की अनुमति देती है। कई कार्यप्रवाह और सॉफ़्टवेयर पैकेज बनाए गए हैं जो एकल-कोशिका ट्रांसक्रिप्टोमिक डेटा को प्रोसेस और विश्लेषण करने के लिए हैं। ये पैकेज उपयोगकर्ताओं को एकल-कोशिका आधारित प्रयोगों में उत्पन्न आंकड़ों की विशाल मापदंडता को लेना और डेटा को नवीन अंतर्दृष्टियों में परिष्कृत करने की अनुमति देते हैं। ट्रांसक्रिप्टोमिक क्षेत्र के विपरीत, एकल-कोशिका इम्यून रिसेप्टर प्रोफाइलिंग के लिए सॉफ़्टवेयर के विकल्पों की कमी है। उपयोगकर्ताओं को mRNA और इम्यून प्रोफाइलिंग को आसानी से संयोजित करने में सक्षम बनाने के लिए, scRepertoire को 10x जीनोमिक्स क्रोमियम इम्यून प्रोफाइलिंग से उत्पन्न डेटा को प्रोसेस करने के लिए बनाया गया था जो दोनों T-cell रिसेप्टर (TCR) और इम्यूनोग्लোবिन (Ig) समृद्धि कार्यप्रवाहों के लिए होता है और इसके बाद एकल-कोशिका अभिव्यक्ति के लिए कई लोकप्रिय R पैकेजों के साथ बातचीत करता है, जैसे कि Seurat। scRepertoire R पैकेज और प्रोसेस किया गया डेटा ओपन सोर्स है और GitHub पर उपलब्ध है और पैकेज की क्षमताओं पर गहन ट्यूटोरियल प्रदान करता है।