トウモロコシY1遺伝子周辺の多様性とリンケージ不均衡の長距離パターンは、非対称的選択スイープを示唆している

黄コーンと白コーンは、祖先由来のオープンポリネーション品種の中で存在します。最近、ブリーダーは、胚乳組織におけるY1フィトエン合成酵素遺伝子産物の上昇により栄養価が向上する黄胚乳の変異体を祖先の白い表現型より選択してきました。その結果、Y1遺伝子における黄色トウモロコシ系統内の多様性は、白コーンと比較して劇的に減少しています。我々は、Y1遺伝子から様々な距離に位置する九つの低コピー領域における配列多様性とリンケージ不均衡のパターンを解析しました。大麦Mlo遺伝子のホモログを含み、情報を持つ一塩基多型と胚乳色表現型、リンケージ不均衡、黄色胚乳ハプロタイプ内の著しく減少した多様性との重要な関連のような選択的スイープに一致するパターンがY1の下流600 kbまで観察されましたが、上流領域はより迅速な回復を示しました。デンプン分岐酵素1（sbe1）遺伝子は、黄色胚乳遺伝資源内で高保存されたハプロタイプを持たないY1の下流に位置する最初の領域です。