PDBML: XML로 된 아카이브 거대분자 구조 데이터의 표현

요약: 단백질 데이터 은행(Protein Data Bank, PDB)은 최근 PDB Exchange 사전과 PDB 아카이브 데이터 파일의 XML 형식 버전을 PDBML이라는 이름으로 발표하였습니다. 이러한 XML 파일의 자동 생성은 PDB에서 사용 중인 데이터 사전 인프라에 의해 구동됩니다. PDB 사전과 XML 스키마 메타데이터 간의 대응을 설명하며, PDB 사전과 데이터 파일의 XML 표현에 대해서도 설명합니다. 가용성: 현재 소프트웨어로 변환된 XML 스키마 파일은 http://deposit.pdb.org/pdbML/pdbx-v1.000.xsd에서 확인할 수 있으며, PDB mmCIF 리소스 페이지인 http://deposit.pdb.org/mmcif/에서도 확인할 수 있습니다. PDBML 파일은 PDB 베타 ftp 사이트인 ftp://beta.rcsb.org/pub/pdb/uniformity/data/XML에 저장됩니다. 연락처: jwest@rcsb.rutgers.edu