FieldScreen: Selección Virtual Usando Campos Moleculares. Aplicación al Conjunto de Datos DUD

Se describe FieldScreen, un método de Selección Virtual (VS) basado en ligandos. Su uso de campos moleculares 3D lo hace particularmente adecuado para saltos de andamiaje, y lo hemos validado rigurosamente para este propósito usando una versión agrupada del Directorio de Engaños Útiles (DUD). Usando trece objetivos farmacéuticamente relevantes, demostramos que FieldScreen produce enriquecimientos tempranos de quimiotipos superiores en comparación con DOCK. Además, los hits recuperados por FieldScreen son consistentemente de menor peso molecular que aquellos recuperados por acoplamiento. Donde no hay estructuras de proteínas por rayos X disponibles, las búsquedas de FieldScreen son más robustas que el acoplamiento en modelos de homología o estructuras apo.