CASP8における領域境界予測の評価と分子内接触の予測

この記事では、第8回蛋白質構造予測の重要評価実験（CASP8）における2つのカテゴリの評価プロセスと評価結果について詳述しています。領域予測カテゴリは、正規化領域オーバーラップスコアや領域境界距離測定を含むさまざまなスコアで評価されました。残基-残基接触予測は、標準的なCASP測定、予測精度、Xdで評価されました。領域境界予測カテゴリでは、予測手法は構造テンプレートを持つターゲットに対しては信頼できる予測を行う一方で、CASPでの限られたアブイニシオターゲットに対しては良好な予測を行うのには苦労しています。領域予測カテゴリでは改善の兆しはあまり見られませんでした。接触予測カテゴリは、予測者の間で新たな関心が示され、サンプルサイズが小さいにもかかわらず、予測精度の向上が示唆されました。CASP7とは対照的に、接触専門家は大多数の三次構造予測者よりも接触をより正確に予測しました。この小さな成功にもかかわらず、自由モデリングターゲットの不足により、どちらのカテゴリもCASP9に現状の形で含まれる可能性は低いです。