SARS-CoV-2の起源と進化

重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2（SARS-CoV-2）は、コロナウイルス病の世界的な流行（以下、COVID-19と呼ぶ）の原因となっています。同じ系統群に属する他のウイルスは、SARSやMERSを含む以前の地域的な流行の原因となっていました。SARS-CoV-2は、これらの以前の流行の原因ウイルスと同様に、動物由来の起源を持っています。動物ウイルスが人間の集団に繰り返し持ち込まれ、病気の流行を引き起こすことは、類似の将来の流行が避けられないことを示唆しています。したがって、SARS-CoV-2の分子起源と進化の理解は、将来の流行の準備と予防に向けた重要な洞察を提供します。SARS-CoV-2の重要な特徴は、宿主種を超えた遺伝子再集合の傾向です。その結果、SARS-CoV-2のゲノムには、複数の再集合イベントの痕跡が含まれ、複数の種や広範な地理的地域を涵蓋していると考えられます。SARS-CoV-2のゲノムの他の領域は、精製選択の影響を示しています。SARS-CoV-2のスパイク（S）プロテインは、ウイルスが宿主細胞に侵入するのを可能にし、精製選択と祖先の再集合イベントの両方の痕跡を示し、人間や多くの他の哺乳類細胞に感染可能な効果的なSプロテインにつながっています。SARS-CoV-2集団の世界的な広がりと爆発的な成長（人間宿主内）は、このゲノムに追加の突然変異の多様性をもたらし、将来の再集合の機会を増加させています。